呼吸道合胞病毒属于肺炎病毒科，正肺病毒属，为非阶段性单股负链RNA病毒。是引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染最重要的病毒病原体，占所有儿童急性下呼吸道感染的22%。呼吸道合胞病毒可导致婴幼儿毛细支气管炎和肺炎，严重者可发生呼吸衰竭，甚至死亡。也可引起上呼吸道感染或中耳炎。
流感病毒是急性呼吸道感染的重要病原体。人群普遍易感，儿童和老年人感染后危害最为严重，每年可引起季节性流行，亦可引起暴发疫情。流感病毒可分为甲、乙、丙，共3型，在全球广泛流行，但不同地区的型别和流行规模有所不同。流感病毒感染后引起的临床表现轻重不一，包括无症状感染、上下呼吸道感染，重症可进展为肺炎，并发心肌炎、脑膜炎或脑炎，甚至危及生命。
副流感病毒属于副黏病毒科，有4个血清型，HPIV1和HPIV3属于呼吸道病毒属，HPIV2和HPIV4属于腮腺炎病毒属。通常副流感病毒的流行是散发的，无明显季节性。副流感病毒感染可以引起鼻炎、咽炎、喉炎、气管支气管炎、细支气管炎和肺炎等，也可引起鼻窦炎和中耳炎。
HRV属小核糖核酸RNA病毒科，肠道病毒属。在全球范围内流行，一年四季均可发病。HRV感染后主要表现为普通感染症状，可引起喘息和哮喘急性加重。也可引起婴幼儿的支气管炎和毛细支气管炎。
腺病毒感染在一年四季均可发生，可表现为上下呼吸道感染，是儿童重症肺炎的重要病原体，可导致危重患者出现休克、呼吸道衰竭、弥散性血管内凝血等，甚至导致死亡。
来源：Medical Microbiology and Immunology (2020) 209:325–333
人偏肺病毒是导致儿童呼吸道感染的重要原体之一。在急性呼吸道感染住院患者中，人偏肺病毒感染约占6.24%。严重者感染者可发展为细支气管炎和肺炎。也可能导致中枢神经系统疾病，如癫痫、脑炎等。
冠状病毒是上呼吸道感染常见病原体，其中15%-30%的普通感冒是由冠状病毒引起的。可分为普通冠状病毒和高致病性冠状病毒。
1）普通冠状病毒
引起儿童呼吸道感染的常见普通HCoV有4种，分别为α属的HCoV-229E、HCoV-NL63，β属的HCoV-OC43、HCoV-HKU1。通常引起上呼吸道感染，多为自限性，但在婴幼儿、老年人或免疫缺陷患者也可引起严重的下呼吸道感染，表现为喘息、气促等。
2）高致病性冠状病毒，如SARS、MERS、SARS-CoV-2。
博卡病毒属于细小病毒科，细小病毒亚科，博卡病毒属。博卡病毒一年四季均可发生。其感染后的临床表现与呼吸道其他病毒相比无特异性，轻者可无症状，或发热、流涕、咳嗽等，重者可致喘息、呼吸困难等，甚至死亡。
肠道病毒属于小核糖核酸RNA病毒科，肠道病毒属，可分为HEV-A、HEV-B、HEV-C、HEV-D 4组。HEV为全年散发。HEV大多数血清型对人类可致病，即可表现为无症状或者上下呼吸道感染，也可引起包括急性出血性结膜炎、病毒性脑炎、急性迟缓性麻痹、病毒性心肌炎等严重疾病。
10、麻疹病毒（Measles virus，MeV）
麻疹属副黏病毒科麻疹病毒属，是引起麻疹的病原体。麻疹是儿童常见的急性传染病，可引起喉炎、肺炎、心肌炎、脑炎及亚急性硬化性全脑炎等多种并发症，其中肺炎是导致麻疹患儿死亡的最主要原因。
11、腮腺炎病毒（Mumps virus， MuV)
腮腺炎病毒属副黏病毒科腮腺炎病毒属，是流行性腮腺炎的病原体。腮腺炎是儿童常见的急性传染病，可引起脑膜脑炎、睾丸炎、心肌炎、胰腺炎、肾炎等严重并发症。
12、风疹病毒（Rubella virus ，RV)
风疹病毒为披膜病毒科风疹病毒属，是引起风疹的病原体。风疹是儿童常见的急性传染病，通常是一种自限性疾病，可以并发心肌炎、关节炎、肾炎、肝炎及脑炎等。妊娠期感染风疹病毒可导致流产、早产、宫内胎儿死亡、宫内发育迟缓和先天性风疹综合征（CRS)。
来源：Manual for the laboratory diagnosis of measles and rubella virus infection
13、水痘-带状疱疹病毒（varicella-zoster virus，VZV)
VZV属疱疹病毒属，α疱疹病毒亚科，是引起水痘和带状疱疹的病原体。水痘是儿童常见的急性传染病，感染水痘通常为轻微症状，但也可能导致严重并发症，如继发细菌感染（蜂窝组织炎、肺炎等）和神经系统并发症（脑膜炎），甚至致命。
GAS具有β溶血性特点，也称为A组β溶血性链球菌，是致病力最强的链球菌。主要引起上呼吸道感染，包括咽扁桃体炎、化脓性中耳炎、鼻窦炎等，较少引起肺炎和胸膜炎，也可引起肾小球肾炎和急性风湿热。
肺炎链球菌定植在人上呼吸道，可引起上下呼吸道感染，是儿童社区获得性肺炎最常见的细菌性病原体。
流感嗜血杆菌是一种多形性革兰阴性菌，常定植于人上呼吸道，可引起急性中耳炎、急性上颌窦炎、迁延性细菌性支气管炎、肺炎等。
来源：Haemophilus influenzae in Developing Countries
金黄色葡萄球菌常见于皮肤和上呼吸道粘膜，可引起上呼吸道感染，还可导致支气管炎、肺炎、肺脓肿、肺大疱、胸膜炎等。
百日咳是由百日咳杆菌引起的急性传染病。百日咳感染者可出现多种并发症，如肺炎、眼结膜下出血、肺动脉高压、脑病等。
大肠埃希菌为革兰阴性杆菌，可导致腹泻、尿路感染，在呼吸系统常致新生儿和小婴儿肺炎，可伴有脓胸等。
肺炎克雷伯菌是肠杆菌科克雷伯杆菌属的一种细菌，属于人类口腔和肠道正常菌群。肺炎克雷伯菌是社区和医院获得性肺炎的重要细菌性病原体，尤其是碳青霉烯耐药和高毒力肺炎克雷伯菌，肺部可形成空洞、单个或多个脓腔，与其他细菌比较，并发菌血症机会较多。
来源：Klebsiella pneumoniae: Properties, Diseases, Lab Diagnosis
结核病是由一群关系密切的分枝杆菌引起的，统称为结核分枝杆菌复合群，包含至少13个成员，对人类致病的主要为人型，其次是牛型。主要引起原发性肺结核、血型播散性肺结核、支气管内膜结核及胸膜炎等。
铜绿假单胞菌是一种非发酵格兰阴性杆菌，是医院内感染的条件致病菌之一，常常引起术后伤口感染、褥疮、脓肿、化脓性中耳炎等，也是呼吸机相关性肺炎的常见原因。
肺炎支原体是呼吸道感染常见的病原体之一，全年发病，冬季更常见，每3-7年发生一次大流行。肺炎支原体以学龄儿童多见，表现为阵发性刺激性咳嗽，以夜间为重，可少量黏痰或黏液脓性痰，有时咳中带血，也可有呼吸困难、胸痛。发热可持续2-3周，体温正常后仍可遗有咳嗽。严重肺炎支原体感染可出现肺内肺外并发症的重症肺炎。
可引起人类致病的衣原体包括沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis，Ct）、肺炎衣原体（Chlamydia pneumonia，CP）、鹦鹉热衣原体。其中沙眼衣原体可引起结膜炎和婴幼儿肺炎。肺炎衣原体是引起的呼吸道感染约70%是无症状 的或仅具有轻度症状，约30%为社区获得性肺炎。
来源：Chlamydia. Intech; 2012.
在军团菌中，与人类疾病最密切的是嗜肺军团菌（Legionella pneumophila，LP)，其中最常见的是1型和6型。嗜肺军团菌全年可发病，夏秋季多见，可引起社区性肺炎，特别是重症肺炎，还可引起医院内感染和旅游性肺炎。
假丝酵母菌属菌体呈圆形或卵圆形，直径约3-6μm，呈革兰阳性。多种假丝酵母菌都能引起临床症状，但儿童以白色假丝酵母菌（Candida albicans，白念珠菌）感染最常见。临床表现不一，可表现为局部黏膜感染，也可表现为广泛性散播，累计多系统器官。
隐球菌已成为一个重要的真菌感染病原体，在全球广泛分布，其中新型隐球菌（Cryptococcus neoformans）感染最为多见。新型隐球菌可引起致命性脑膜脑炎和/或肺炎，此外还可累及皮肤、软组织、骨、关节、骨髓和淋巴结等。
曲霉菌是一种典型的丝状菌，其感染多见于宿主免疫抑制情况下。如烟曲霉（Aspergillus)可引起变应性支气管肺曲霉病，急性期主要为咳嗽、喘息、咳痰、咳血及发热。此外，还可引起中枢神经系统疾病。
来源：A. Abadetal/RevIberoamMicol.2010;27(4):155–182
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参考文献：
1、Respiratory syncytial virus infection in adults
2、Back to the Future for Influenza Preimmunity—Looking Back at Influenza Virus History to Infer the Outcome of Future Infections.
3、Current management of parainfluenza pneumonitis in immunocompromised patients: a review.
4、Rhinovirus Biology, Antigenic Diversity, and Advancements in the Design of a Human Rhinovirus Vaccine
5、Human adenovirus binding to host cell receptors: a structural view
6、Human Metapneumovirus:Mechanisms and Molecular Targets Used by the Virus to Avoid the Immune System
7、Focus on the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)
8、Recent Advances in BLV Research
9、Human bocaviruses and paediatric infections
10、Viruses and Type 1 Diabetes: Focus on the Enteroviruses
11、Measles to the Rescue: A Review of Oncolytic Measles Virus
12、Mumps in the Vaccination Age: Global Epidemiology and the Situation in Germany
13、Manual for the laboratory diagnosis of measles and rubella virus infection
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